Đoàn trường THCS Nguyễn Chí Thanh từ khi thành lập cho đến nay đã có nhiều năm phát triển và trưởng thành. Cùng với quá trình vận động và phát triển của nhà trường, Đoàn trường không ngừng trưởng thành và đã có những đóng góp quan trọng cho công tác Đoàn và phong trào thanh thiếu niên của địa phương và đặc biệt đối với quá trình xây dựng, phát triển nhà trường về mọi mặt. Ngoài việc phối hợp với Liên đội trong công tác nề nếp, tác phong của học sinh thì các thầy cô giáo trong chi đoàn vẫn luôn tích cực tham gia các hoạt động xã hội cùng với Đoàn địa phương nơi công tác.
Một số hoạt động của chi đoàn:

Tham gia hỗ trợ công tác lấy mẫu xét nghiệm.

Tham gia tuyên truyền tại khu dân cư.

Hỗ trợ đo thân nhiệt cho học sinh.

Hỗ trợ tiêm vắc xin cho học sinh.